На представительство правительства Еврейской автономной области при Правительстве Российской Федерации возлагаются следующие функции и задачи по обеспечению взаимодействия между органами государственной власти области и федеральными органами государственной власти.

Руководители органов исполнительной власти области, командируемые в Москву, действуют в контакте с Представительством, информируют его о целях командировки и проделанной работе.

• Обеспечение оперативного и эффективного взаимодействия государственных органов Российской Федерации и органов государственной власти области.
• Оперативное информирование губернатора и / или правительства области о решении вопросов, внесённых губернатором и / или правительством области, прохождении предложений органов исполнительной власти области в федеральных государственных органах.
• Оперативное информирование губернатора и / или правительства области о подготовке на уровне федеральных государственных органов документов и мероприятий, затрагивающих интересы области.
• Содействие установлению и развитию деловых связей области на межрегиональном уровне.
• Содействие руководителям органов государственной власти области, командированным в г. Москву, в выполнении служебных заданий.
• Содействие органам исполнительной власти области в подготовке договоров (соглашений) с федеральными органами исполнительной власти, их дальнейшего согласования и подписания.
• Обеспечение представления информации по вопросам социально-экономического развития области, а также иной информации по запросам государственных органов Российской Федерации.
• Обеспечение оперативного обмена документами между органами исполнительной власти области и федеральными органами исполнительной власти.